Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clec11aO88200 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clec11aO88200 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clec11aO88200 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clec11aO88200 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clec11aO88200 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clec11aO88200 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clec11aO88200 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clec11aO88200 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clec11aO88200 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clec11aO88200 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clec11aO88200 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clec11aO88200 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clec11aO88200 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clec11aO88200 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clec11aO88200 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Clec11aO88200 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clec11aO88200 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clec11aO88200 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clec11aO88200 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clec11aO88200 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clec11aO88200 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clec11aO88200 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clec11aO88200 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clec11aO88200 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Clec11aO88200 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clec11aO88200 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clec11aO88200 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clec11aO88200 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clec11aO88200 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clec11aO88200 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clec11aO88200 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clec11aO88200 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clec11aO88200 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clec11aO88200 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clec11aO88200 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clec11aO88200 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clec11aO88200 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clec11aO88200 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clec11aO88200 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clec11aO88200 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clec11aO88200 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clec11aO88200 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clec11aO88200 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clec11aO88200 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clec11aO88200 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clec11aO88200 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clec11aO88200 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clec11aO88200 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clec11aO88200 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clec11aO88200 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clec11aO88200 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clec11aO88200 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clec11aO88200 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clec11aO88200 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clec11aO88200 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clec11aO88200 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clec11aO88200 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clec11aO88200 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clec11aO88200 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clec11aO88200 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clec11aO88200 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clec11aO88200 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Clec11aO88200 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms