Protein–RNA interactions for Protein: O70422

Gtf2h4, General transcription factor IIH subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h4O70422 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2h4O70422 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2h4O70422 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2h4O70422 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2h4O70422 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2h4O70422 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2h4O70422 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2h4O70422 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2h4O70422 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2h4O70422 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2h4O70422 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2h4O70422 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2h4O70422 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2h4O70422 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h4O70422 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h4O70422 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2h4O70422 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2h4O70422 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2h4O70422 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2h4O70422 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2h4O70422 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2h4O70422 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2h4O70422 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2h4O70422 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2h4O70422 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2h4O70422 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2h4O70422 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2h4O70422 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2h4O70422 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2h4O70422 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2h4O70422 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2h4O70422 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf2h4O70422 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf2h4O70422 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2h4O70422 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2h4O70422 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2h4O70422 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2h4O70422 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2h4O70422 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2h4O70422 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2h4O70422 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2h4O70422 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2h4O70422 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2h4O70422 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2h4O70422 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2h4O70422 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2h4O70422 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2h4O70422 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2h4O70422 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2h4O70422 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h4O70422 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h4O70422 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2h4O70422 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2h4O70422 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2h4O70422 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2h4O70422 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2h4O70422 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2h4O70422 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2h4O70422 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2h4O70422 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2h4O70422 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2h4O70422 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms