Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RngttO55236 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RngttO55236 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RngttO55236 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RngttO55236 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RngttO55236 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RngttO55236 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RngttO55236 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RngttO55236 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RngttO55236 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RngttO55236 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RngttO55236 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RngttO55236 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RngttO55236 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RngttO55236 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RngttO55236 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RngttO55236 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RngttO55236 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RngttO55236 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RngttO55236 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RngttO55236 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RngttO55236 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RngttO55236 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RngttO55236 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RngttO55236 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RngttO55236 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RngttO55236 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RngttO55236 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RngttO55236 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RngttO55236 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RngttO55236 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RngttO55236 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RngttO55236 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RngttO55236 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RngttO55236 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RngttO55236 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RngttO55236 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RngttO55236 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RngttO55236 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RngttO55236 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RngttO55236 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RngttO55236 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RngttO55236 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RngttO55236 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RngttO55236 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RngttO55236 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RngttO55236 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RngttO55236 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RngttO55236 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RngttO55236 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RngttO55236 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RngttO55236 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RngttO55236 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RngttO55236 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RngttO55236 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RngttO55236 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RngttO55236 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RngttO55236 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RngttO55236 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RngttO55236 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RngttO55236 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RngttO55236 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RngttO55236 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RngttO55236 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RngttO55236 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RngttO55236 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RngttO55236 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RngttO55236 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RngttO55236 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RngttO55236 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RngttO55236 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RngttO55236 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RngttO55236 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RngttO55236 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RngttO55236 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RngttO55236 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RngttO55236 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RngttO55236 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RngttO55236 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RngttO55236 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RngttO55236 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RngttO55236 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RngttO55236 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RngttO55236 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RngttO55236 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RngttO55236 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RngttO55236 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RngttO55236 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RngttO55236 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RngttO55236 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RngttO55236 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RngttO55236 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RngttO55236 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RngttO55236 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RngttO55236 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RngttO55236 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RngttO55236 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RngttO55236 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RngttO55236 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RngttO55236 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms