Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syngr1O55100 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syngr1O55100 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syngr1O55100 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syngr1O55100 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syngr1O55100 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syngr1O55100 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Syngr1O55100 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syngr1O55100 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syngr1O55100 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syngr1O55100 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syngr1O55100 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syngr1O55100 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syngr1O55100 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syngr1O55100 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syngr1O55100 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syngr1O55100 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syngr1O55100 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syngr1O55100 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syngr1O55100 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syngr1O55100 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Syngr1O55100 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syngr1O55100 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syngr1O55100 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syngr1O55100 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syngr1O55100 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syngr1O55100 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syngr1O55100 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syngr1O55100 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syngr1O55100 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syngr1O55100 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syngr1O55100 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syngr1O55100 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syngr1O55100 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Syngr1O55100 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syngr1O55100 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syngr1O55100 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syngr1O55100 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syngr1O55100 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syngr1O55100 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syngr1O55100 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syngr1O55100 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syngr1O55100 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syngr1O55100 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syngr1O55100 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syngr1O55100 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syngr1O55100 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syngr1O55100 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syngr1O55100 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syngr1O55100 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syngr1O55100 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syngr1O55100 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syngr1O55100 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syngr1O55100 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syngr1O55100 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syngr1O55100 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syngr1O55100 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syngr1O55100 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syngr1O55100 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syngr1O55100 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms