Protein–RNA interactions for Protein: O55060

Tpmt, Thiopurine S-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpmtO55060 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TpmtO55060 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TpmtO55060 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TpmtO55060 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TpmtO55060 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TpmtO55060 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TpmtO55060 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TpmtO55060 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TpmtO55060 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TpmtO55060 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TpmtO55060 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TpmtO55060 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TpmtO55060 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TpmtO55060 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TpmtO55060 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TpmtO55060 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TpmtO55060 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TpmtO55060 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TpmtO55060 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TpmtO55060 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TpmtO55060 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TpmtO55060 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TpmtO55060 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TpmtO55060 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TpmtO55060 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TpmtO55060 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TpmtO55060 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TpmtO55060 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TpmtO55060 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TpmtO55060 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TpmtO55060 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TpmtO55060 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TpmtO55060 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TpmtO55060 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TpmtO55060 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TpmtO55060 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TpmtO55060 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TpmtO55060 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TpmtO55060 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TpmtO55060 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TpmtO55060 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TpmtO55060 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TpmtO55060 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TpmtO55060 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TpmtO55060 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TpmtO55060 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TpmtO55060 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TpmtO55060 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TpmtO55060 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TpmtO55060 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TpmtO55060 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TpmtO55060 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TpmtO55060 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TpmtO55060 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TpmtO55060 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TpmtO55060 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TpmtO55060 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TpmtO55060 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TpmtO55060 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TpmtO55060 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TpmtO55060 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TpmtO55060 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TpmtO55060 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TpmtO55060 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TpmtO55060 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TpmtO55060 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TpmtO55060 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TpmtO55060 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TpmtO55060 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TpmtO55060 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TpmtO55060 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms