Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smarce1O54941 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarce1O54941 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarce1O54941 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarce1O54941 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarce1O54941 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarce1O54941 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarce1O54941 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarce1O54941 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarce1O54941 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarce1O54941 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarce1O54941 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarce1O54941 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarce1O54941 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarce1O54941 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarce1O54941 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarce1O54941 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarce1O54941 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarce1O54941 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarce1O54941 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarce1O54941 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarce1O54941 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarce1O54941 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Smarce1O54941 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarce1O54941 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarce1O54941 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarce1O54941 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarce1O54941 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarce1O54941 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarce1O54941 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarce1O54941 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarce1O54941 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarce1O54941 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarce1O54941 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarce1O54941 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarce1O54941 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarce1O54941 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarce1O54941 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarce1O54941 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarce1O54941 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarce1O54941 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarce1O54941 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarce1O54941 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarce1O54941 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarce1O54941 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarce1O54941 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarce1O54941 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarce1O54941 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarce1O54941 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarce1O54941 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarce1O54941 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarce1O54941 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarce1O54941 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarce1O54941 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarce1O54941 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarce1O54941 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarce1O54941 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarce1O54941 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarce1O54941 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarce1O54941 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarce1O54941 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarce1O54941 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarce1O54941 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarce1O54941 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarce1O54941 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarce1O54941 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarce1O54941 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarce1O54941 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarce1O54941 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarce1O54941 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms