Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd200O54901 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd200O54901 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd200O54901 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200O54901 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms