Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd200O54901 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd200O54901 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd200O54901 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd200O54901 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd200O54901 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd200O54901 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd200O54901 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd200O54901 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd200O54901 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200O54901 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms