Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cavin1O54724 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cavin1O54724 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cavin1O54724 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cavin1O54724 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cavin1O54724 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cavin1O54724 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cavin1O54724 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cavin1O54724 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cavin1O54724 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cavin1O54724 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cavin1O54724 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cavin1O54724 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cavin1O54724 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cavin1O54724 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cavin1O54724 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cavin1O54724 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cavin1O54724 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cavin1O54724 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cavin1O54724 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cavin1O54724 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cavin1O54724 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cavin1O54724 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cavin1O54724 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cavin1O54724 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cavin1O54724 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cavin1O54724 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cavin1O54724 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cavin1O54724 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cavin1O54724 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cavin1O54724 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cavin1O54724 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cavin1O54724 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cavin1O54724 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cavin1O54724 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cavin1O54724 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cavin1O54724 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cavin1O54724 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cavin1O54724 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cavin1O54724 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cavin1O54724 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cavin1O54724 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cavin1O54724 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cavin1O54724 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cavin1O54724 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cavin1O54724 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms