Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Emp3O35912 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Emp3O35912 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Emp3O35912 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Emp3O35912 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Emp3O35912 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Emp3O35912 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Emp3O35912 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Emp3O35912 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Emp3O35912 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Emp3O35912 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Emp3O35912 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Emp3O35912 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Emp3O35912 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Emp3O35912 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Emp3O35912 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Emp3O35912 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Emp3O35912 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Emp3O35912 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Emp3O35912 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Emp3O35912 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Emp3O35912 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Emp3O35912 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Emp3O35912 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Emp3O35912 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Emp3O35912 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Emp3O35912 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Emp3O35912 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Emp3O35912 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Emp3O35912 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Emp3O35912 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Emp3O35912 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Emp3O35912 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Emp3O35912 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Emp3O35912 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Emp3O35912 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Emp3O35912 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Emp3O35912 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Emp3O35912 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Emp3O35912 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Emp3O35912 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Emp3O35912 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Emp3O35912 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Emp3O35912 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Emp3O35912 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Emp3O35912 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Emp3O35912 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Emp3O35912 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Emp3O35912 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Emp3O35912 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Emp3O35912 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Emp3O35912 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Emp3O35912 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Emp3O35912 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms