Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf12O35738 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf12O35738 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf12O35738 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf12O35738 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf12O35738 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf12O35738 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf12O35738 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf12O35738 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf12O35738 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf12O35738 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf12O35738 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf12O35738 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf12O35738 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf12O35738 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klf12O35738 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf12O35738 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf12O35738 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf12O35738 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf12O35738 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf12O35738 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf12O35738 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf12O35738 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf12O35738 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf12O35738 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf12O35738 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf12O35738 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf12O35738 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms