Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KeraO35367 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KeraO35367 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KeraO35367 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KeraO35367 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KeraO35367 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KeraO35367 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KeraO35367 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KeraO35367 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KeraO35367 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KeraO35367 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KeraO35367 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KeraO35367 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KeraO35367 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KeraO35367 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KeraO35367 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KeraO35367 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KeraO35367 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KeraO35367 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KeraO35367 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KeraO35367 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KeraO35367 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KeraO35367 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KeraO35367 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KeraO35367 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KeraO35367 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KeraO35367 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KeraO35367 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KeraO35367 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KeraO35367 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KeraO35367 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KeraO35367 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KeraO35367 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KeraO35367 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KeraO35367 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KeraO35367 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KeraO35367 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KeraO35367 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KeraO35367 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KeraO35367 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KeraO35367 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KeraO35367 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KeraO35367 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KeraO35367 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KeraO35367 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KeraO35367 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KeraO35367 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KeraO35367 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KeraO35367 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KeraO35367 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KeraO35367 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KeraO35367 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KeraO35367 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KeraO35367 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KeraO35367 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KeraO35367 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KeraO35367 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KeraO35367 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KeraO35367 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KeraO35367 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KeraO35367 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KeraO35367 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KeraO35367 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KeraO35367 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KeraO35367 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KeraO35367 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KeraO35367 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KeraO35367 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KeraO35367 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KeraO35367 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KeraO35367 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KeraO35367 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KeraO35367 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KeraO35367 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KeraO35367 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KeraO35367 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KeraO35367 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KeraO35367 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KeraO35367 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KeraO35367 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KeraO35367 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KeraO35367 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KeraO35367 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KeraO35367 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KeraO35367 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KeraO35367 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KeraO35367 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KeraO35367 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KeraO35367 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KeraO35367 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KeraO35367 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KeraO35367 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KeraO35367 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KeraO35367 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KeraO35367 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KeraO35367 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KeraO35367 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KeraO35367 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KeraO35367 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KeraO35367 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms