Protein–RNA interactions for Protein: O35242

Nsmaf, Protein FAN, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmafO35242 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsmafO35242 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsmafO35242 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsmafO35242 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmafO35242 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmafO35242 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsmafO35242 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsmafO35242 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NsmafO35242 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsmafO35242 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsmafO35242 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NsmafO35242 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NsmafO35242 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NsmafO35242 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NsmafO35242 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsmafO35242 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NsmafO35242 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NsmafO35242 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmafO35242 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmafO35242 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsmafO35242 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NsmafO35242 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NsmafO35242 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NsmafO35242 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmafO35242 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NsmafO35242 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NsmafO35242 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NsmafO35242 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsmafO35242 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NsmafO35242 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NsmafO35242 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NsmafO35242 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NsmafO35242 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsmafO35242 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsmafO35242 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsmafO35242 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsmafO35242 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NsmafO35242 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmafO35242 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmafO35242 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsmafO35242 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NsmafO35242 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms