Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcns1O35173 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcns1O35173 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcns1O35173 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcns1O35173 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcns1O35173 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcns1O35173 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcns1O35173 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcns1O35173 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcns1O35173 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcns1O35173 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcns1O35173 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcns1O35173 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcns1O35173 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcns1O35173 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcns1O35173 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcns1O35173 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcns1O35173 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcns1O35173 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcns1O35173 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcns1O35173 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcns1O35173 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcns1O35173 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcns1O35173 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcns1O35173 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcns1O35173 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcns1O35173 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcns1O35173 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcns1O35173 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcns1O35173 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcns1O35173 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcns1O35173 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcns1O35173 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcns1O35173 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcns1O35173 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcns1O35173 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcns1O35173 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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