Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClockO08785 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClockO08785 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClockO08785 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClockO08785 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClockO08785 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClockO08785 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClockO08785 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClockO08785 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClockO08785 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClockO08785 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ClockO08785 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClockO08785 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClockO08785 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClockO08785 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClockO08785 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClockO08785 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClockO08785 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClockO08785 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClockO08785 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClockO08785 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClockO08785 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClockO08785 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClockO08785 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClockO08785 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClockO08785 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClockO08785 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClockO08785 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClockO08785 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClockO08785 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ClockO08785 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClockO08785 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClockO08785 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClockO08785 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClockO08785 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClockO08785 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClockO08785 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ClockO08785 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ClockO08785 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClockO08785 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ClockO08785 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClockO08785 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClockO08785 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClockO08785 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClockO08785 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClockO08785 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClockO08785 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClockO08785 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClockO08785 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClockO08785 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClockO08785 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClockO08785 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ClockO08785 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ClockO08785 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClockO08785 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClockO08785 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClockO08785 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ClockO08785 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClockO08785 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClockO08785 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClockO08785 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ClockO08785 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClockO08785 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClockO08785 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClockO08785 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClockO08785 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClockO08785 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClockO08785 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ClockO08785 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ClockO08785 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClockO08785 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClockO08785 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClockO08785 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClockO08785 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClockO08785 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClockO08785 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClockO08785 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClockO08785 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClockO08785 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClockO08785 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClockO08785 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClockO08785 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClockO08785 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClockO08785 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClockO08785 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClockO08785 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClockO08785 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClockO08785 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClockO08785 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClockO08785 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClockO08785 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClockO08785 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClockO08785 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClockO08785 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ClockO08785 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClockO08785 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClockO08785 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClockO08785 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClockO08785 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClockO08785 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms