Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rundc3aO08576 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc3aO08576 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc3aO08576 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rundc3aO08576 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rundc3aO08576 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rundc3aO08576 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rundc3aO08576 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc3aO08576 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc3aO08576 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rundc3aO08576 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rundc3aO08576 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rundc3aO08576 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc3aO08576 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc3aO08576 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rundc3aO08576 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc3aO08576 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc3aO08576 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc3aO08576 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc3aO08576 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc3aO08576 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rundc3aO08576 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc3aO08576 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rundc3aO08576 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc3aO08576 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc3aO08576 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rundc3aO08576 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rundc3aO08576 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rundc3aO08576 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rundc3aO08576 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rundc3aO08576 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc3aO08576 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc3aO08576 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rundc3aO08576 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rundc3aO08576 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rundc3aO08576 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rundc3aO08576 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rundc3aO08576 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rundc3aO08576 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc3aO08576 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc3aO08576 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rundc3aO08576 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rundc3aO08576 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rundc3aO08576 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rundc3aO08576 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rundc3aO08576 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rundc3aO08576 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc3aO08576 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc3aO08576 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc3aO08576 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc3aO08576 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc3aO08576 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rundc3aO08576 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms