Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IfnabL7MTU6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IfnabL7MTU6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IfnabL7MTU6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IfnabL7MTU6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IfnabL7MTU6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IfnabL7MTU6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IfnabL7MTU6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IfnabL7MTU6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IfnabL7MTU6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IfnabL7MTU6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IfnabL7MTU6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IfnabL7MTU6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IfnabL7MTU6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IfnabL7MTU6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IfnabL7MTU6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IfnabL7MTU6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IfnabL7MTU6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IfnabL7MTU6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IfnabL7MTU6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IfnabL7MTU6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IfnabL7MTU6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IfnabL7MTU6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IfnabL7MTU6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IfnabL7MTU6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IfnabL7MTU6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IfnabL7MTU6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IfnabL7MTU6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IfnabL7MTU6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IfnabL7MTU6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IfnabL7MTU6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IfnabL7MTU6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IfnabL7MTU6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IfnabL7MTU6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IfnabL7MTU6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IfnabL7MTU6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IfnabL7MTU6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
IfnabL7MTU6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms