Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
1700122O11RikJ3QPW6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700122O11RikJ3QPW6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700122O11RikJ3QPW6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700122O11RikJ3QPW6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700122O11RikJ3QPW6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700122O11RikJ3QPW6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1700122O11RikJ3QPW6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700122O11RikJ3QPW6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700122O11RikJ3QPW6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700122O11RikJ3QPW6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700122O11RikJ3QPW6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700122O11RikJ3QPW6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700122O11RikJ3QPW6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700122O11RikJ3QPW6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700122O11RikJ3QPW6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700122O11RikJ3QPW6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700122O11RikJ3QPW6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700122O11RikJ3QPW6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700122O11RikJ3QPW6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700122O11RikJ3QPW6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700122O11RikJ3QPW6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700122O11RikJ3QPW6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700122O11RikJ3QPW6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700122O11RikJ3QPW6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700122O11RikJ3QPW6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700122O11RikJ3QPW6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700122O11RikJ3QPW6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700122O11RikJ3QPW6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700122O11RikJ3QPW6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700122O11RikJ3QPW6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700122O11RikJ3QPW6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700122O11RikJ3QPW6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700122O11RikJ3QPW6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700122O11RikJ3QPW6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms