Protein–RNA interactions for Protein: J3QP72

Gm21738, Predicted gene, 21738, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21738J3QP72 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm21738J3QP72 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm21738J3QP72 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm21738J3QP72 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm21738J3QP72 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm21738J3QP72 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm21738J3QP72 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm21738J3QP72 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm21738J3QP72 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm21738J3QP72 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm21738J3QP72 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm21738J3QP72 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm21738J3QP72 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm21738J3QP72 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm21738J3QP72 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm21738J3QP72 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm21738J3QP72 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm21738J3QP72 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm21738J3QP72 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm21738J3QP72 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm21738J3QP72 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm21738J3QP72 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm21738J3QP72 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm21738J3QP72 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm21738J3QP72 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm21738J3QP72 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm21738J3QP72 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms