Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c2J3QNM1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c2J3QNM1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c2J3QNM1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c2J3QNM1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c2J3QNM1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34c2J3QNM1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34c2J3QNM1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c2J3QNM1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c2J3QNM1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c2J3QNM1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c2J3QNM1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c2J3QNM1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn34c2J3QNM1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34c2J3QNM1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn34c2J3QNM1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34c2J3QNM1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34c2J3QNM1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34c2J3QNM1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn34c2J3QNM1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn34c2J3QNM1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34c2J3QNM1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34c2J3QNM1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34c2J3QNM1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34c2J3QNM1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn34c2J3QNM1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34c2J3QNM1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34c2J3QNM1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34c2J3QNM1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34c2J3QNM1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34c2J3QNM1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34c2J3QNM1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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