Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a18J3QN01 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a18J3QN01 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a18J3QN01 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a18J3QN01 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a18J3QN01 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a18J3QN01 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a18J3QN01 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a18J3QN01 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a18J3QN01 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a18J3QN01 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a18J3QN01 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a18J3QN01 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ms4a18J3QN01 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a18J3QN01 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a18J3QN01 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a18J3QN01 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a18J3QN01 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a18J3QN01 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a18J3QN01 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a18J3QN01 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a18J3QN01 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a18J3QN01 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a18J3QN01 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a18J3QN01 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a18J3QN01 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ms4a18J3QN01 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a18J3QN01 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a18J3QN01 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a18J3QN01 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a18J3QN01 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a18J3QN01 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a18J3QN01 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a18J3QN01 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a18J3QN01 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a18J3QN01 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a18J3QN01 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a18J3QN01 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a18J3QN01 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a18J3QN01 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a18J3QN01 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a18J3QN01 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a18J3QN01 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a18J3QN01 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a18J3QN01 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a18J3QN01 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a18J3QN01 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms