Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34c3J3QJW5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn34c3J3QJW5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34c3J3QJW5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn34c3J3QJW5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34c3J3QJW5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34c3J3QJW5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34c3J3QJW5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34c3J3QJW5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34c3J3QJW5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms