Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r67G5E8C1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r67G5E8C1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r67G5E8C1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r67G5E8C1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r67G5E8C1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r67G5E8C1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r67G5E8C1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r67G5E8C1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r67G5E8C1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r67G5E8C1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r67G5E8C1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r67G5E8C1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r67G5E8C1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r67G5E8C1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r67G5E8C1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r67G5E8C1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r67G5E8C1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r67G5E8C1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r67G5E8C1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r67G5E8C1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r67G5E8C1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r67G5E8C1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r67G5E8C1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r67G5E8C1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r67G5E8C1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r67G5E8C1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r67G5E8C1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn1r67G5E8C1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r67G5E8C1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r67G5E8C1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r67G5E8C1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r67G5E8C1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r67G5E8C1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r67G5E8C1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r67G5E8C1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r67G5E8C1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r67G5E8C1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms