Protein–RNA interactions for Protein: G3X992

Msl3l2, MSL3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3l2G3X992 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msl3l2G3X992 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msl3l2G3X992 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msl3l2G3X992 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msl3l2G3X992 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msl3l2G3X992 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msl3l2G3X992 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msl3l2G3X992 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msl3l2G3X992 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msl3l2G3X992 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msl3l2G3X992 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msl3l2G3X992 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msl3l2G3X992 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msl3l2G3X992 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msl3l2G3X992 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msl3l2G3X992 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msl3l2G3X992 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msl3l2G3X992 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msl3l2G3X992 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msl3l2G3X992 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msl3l2G3X992 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msl3l2G3X992 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msl3l2G3X992 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3l2G3X992 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3l2G3X992 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Msl3l2G3X992 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msl3l2G3X992 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3l2G3X992 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msl3l2G3X992 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msl3l2G3X992 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3l2G3X992 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3l2G3X992 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3l2G3X992 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3l2G3X992 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3l2G3X992 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3l2G3X992 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msl3l2G3X992 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msl3l2G3X992 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msl3l2G3X992 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms