Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcdh11xF6ZNL5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcdh11xF6ZNL5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcdh11xF6ZNL5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcdh11xF6ZNL5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcdh11xF6ZNL5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcdh11xF6ZNL5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcdh11xF6ZNL5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcdh11xF6ZNL5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcdh11xF6ZNL5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pcdh11xF6ZNL5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Pcdh11xF6ZNL5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pcdh11xF6ZNL5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcdh11xF6ZNL5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pcdh11xF6ZNL5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pcdh11xF6ZNL5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcdh11xF6ZNL5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcdh11xF6ZNL5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcdh11xF6ZNL5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcdh11xF6ZNL5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcdh11xF6ZNL5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcdh11xF6ZNL5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcdh11xF6ZNL5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcdh11xF6ZNL5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcdh11xF6ZNL5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcdh11xF6ZNL5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcdh11xF6ZNL5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcdh11xF6ZNL5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcdh11xF6ZNL5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcdh11xF6ZNL5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcdh11xF6ZNL5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcdh11xF6ZNL5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcdh11xF6ZNL5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcdh11xF6ZNL5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcdh11xF6ZNL5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcdh11xF6ZNL5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcdh11xF6ZNL5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcdh11xF6ZNL5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcdh11xF6ZNL5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcdh11xF6ZNL5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcdh11xF6ZNL5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcdh11xF6ZNL5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcdh11xF6ZNL5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcdh11xF6ZNL5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcdh11xF6ZNL5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcdh11xF6ZNL5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcdh11xF6ZNL5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcdh11xF6ZNL5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcdh11xF6ZNL5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcdh11xF6ZNL5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcdh11xF6ZNL5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcdh11xF6ZNL5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pcdh11xF6ZNL5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Pcdh11xF6ZNL5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms