Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8220F6YKI2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8220F6YKI2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8220F6YKI2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8220F6YKI2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8220F6YKI2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8220F6YKI2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8220F6YKI2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8220F6YKI2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8220F6YKI2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8220F6YKI2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8220F6YKI2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8220F6YKI2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8220F6YKI2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8220F6YKI2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8220F6YKI2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8220F6YKI2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8220F6YKI2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8220F6YKI2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8220F6YKI2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8220F6YKI2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8220F6YKI2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8220F6YKI2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8220F6YKI2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8220F6YKI2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8220F6YKI2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8220F6YKI2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8220F6YKI2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8220F6YKI2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8220F6YKI2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8220F6YKI2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8220F6YKI2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8220F6YKI2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8220F6YKI2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8220F6YKI2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8220F6YKI2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8220F6YKI2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8220F6YKI2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm8220F6YKI2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gm8220F6YKI2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms