Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa35E9QLQ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Defa35E9QLQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa35E9QLQ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa35E9QLQ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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