Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r35E9Q7U8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r35E9Q7U8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r35E9Q7U8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r35E9Q7U8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r35E9Q7U8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r35E9Q7U8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r35E9Q7U8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r35E9Q7U8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r35E9Q7U8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r35E9Q7U8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r35E9Q7U8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r35E9Q7U8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r35E9Q7U8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r35E9Q7U8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r35E9Q7U8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r35E9Q7U8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r35E9Q7U8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r35E9Q7U8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r35E9Q7U8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r35E9Q7U8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r35E9Q7U8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r35E9Q7U8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r35E9Q7U8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r35E9Q7U8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r35E9Q7U8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn2r35E9Q7U8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r35E9Q7U8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r35E9Q7U8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms