Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ythdc1E9Q5K9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ythdc1E9Q5K9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ythdc1E9Q5K9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ythdc1E9Q5K9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ythdc1E9Q5K9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ythdc1E9Q5K9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ythdc1E9Q5K9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ythdc1E9Q5K9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ythdc1E9Q5K9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ythdc1E9Q5K9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ythdc1E9Q5K9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ythdc1E9Q5K9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ythdc1E9Q5K9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ythdc1E9Q5K9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ythdc1E9Q5K9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ythdc1E9Q5K9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ythdc1E9Q5K9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ythdc1E9Q5K9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ythdc1E9Q5K9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ythdc1E9Q5K9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ythdc1E9Q5K9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc1E9Q5K9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ythdc1E9Q5K9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ythdc1E9Q5K9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ythdc1E9Q5K9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ythdc1E9Q5K9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ythdc1E9Q5K9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ythdc1E9Q5K9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ythdc1E9Q5K9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ythdc1E9Q5K9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ythdc1E9Q5K9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ythdc1E9Q5K9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ythdc1E9Q5K9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ythdc1E9Q5K9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ythdc1E9Q5K9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ythdc1E9Q5K9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc1E9Q5K9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ythdc1E9Q5K9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ythdc1E9Q5K9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ythdc1E9Q5K9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ythdc1E9Q5K9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ythdc1E9Q5K9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ythdc1E9Q5K9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ythdc1E9Q5K9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ythdc1E9Q5K9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ythdc1E9Q5K9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ythdc1E9Q5K9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ythdc1E9Q5K9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ythdc1E9Q5K9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms