Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Setd2E9Q5F9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Setd2E9Q5F9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Setd2E9Q5F9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Setd2E9Q5F9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Setd2E9Q5F9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd2E9Q5F9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd2E9Q5F9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Setd2E9Q5F9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Setd2E9Q5F9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd2E9Q5F9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd2E9Q5F9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd2E9Q5F9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd2E9Q5F9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd2E9Q5F9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd2E9Q5F9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd2E9Q5F9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd2E9Q5F9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd2E9Q5F9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd2E9Q5F9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd2E9Q5F9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd2E9Q5F9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd2E9Q5F9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd2E9Q5F9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd2E9Q5F9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd2E9Q5F9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd2E9Q5F9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd2E9Q5F9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Setd2E9Q5F9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Setd2E9Q5F9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd2E9Q5F9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd2E9Q5F9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Setd2E9Q5F9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd2E9Q5F9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd2E9Q5F9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd2E9Q5F9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd2E9Q5F9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd2E9Q5F9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd2E9Q5F9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd2E9Q5F9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd2E9Q5F9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd2E9Q5F9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd2E9Q5F9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd2E9Q5F9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd2E9Q5F9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd2E9Q5F9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd2E9Q5F9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd2E9Q5F9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd2E9Q5F9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd2E9Q5F9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd2E9Q5F9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd2E9Q5F9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd2E9Q5F9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd2E9Q5F9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd2E9Q5F9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd2E9Q5F9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd2E9Q5F9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd2E9Q5F9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd2E9Q5F9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd2E9Q5F9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd2E9Q5F9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd2E9Q5F9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd2E9Q5F9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd2E9Q5F9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd2E9Q5F9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms