Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh3b2E9Q3E1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh3b2E9Q3E1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh3b2E9Q3E1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Aldh3b2E9Q3E1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh3b2E9Q3E1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh3b2E9Q3E1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aldh3b2E9Q3E1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aldh3b2E9Q3E1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aldh3b2E9Q3E1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aldh3b2E9Q3E1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Aldh3b2E9Q3E1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aldh3b2E9Q3E1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh3b2E9Q3E1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh3b2E9Q3E1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh3b2E9Q3E1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh3b2E9Q3E1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh3b2E9Q3E1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aldh3b2E9Q3E1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aldh3b2E9Q3E1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aldh3b2E9Q3E1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aldh3b2E9Q3E1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aldh3b2E9Q3E1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aldh3b2E9Q3E1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aldh3b2E9Q3E1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Aldh3b2E9Q3E1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Aldh3b2E9Q3E1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms