Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4f2E9Q366 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4f2E9Q366 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4f2E9Q366 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4f2E9Q366 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4f2E9Q366 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4f2E9Q366 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4f2E9Q366 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4f2E9Q366 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4f2E9Q366 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4f2E9Q366 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4f2E9Q366 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f2E9Q366 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4f2E9Q366 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f2E9Q366 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4f2E9Q366 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4f2E9Q366 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4f2E9Q366 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4f2E9Q366 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4f2E9Q366 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4f2E9Q366 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4f2E9Q366 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4f2E9Q366 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4f2E9Q366 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4f2E9Q366 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4f2E9Q366 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4f2E9Q366 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4f2E9Q366 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4f2E9Q366 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4f2E9Q366 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4f2E9Q366 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Speer4f2E9Q366 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Speer4f2E9Q366 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Speer4f2E9Q366 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f2E9Q366 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f2E9Q366 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f2E9Q366 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f2E9Q366 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4f2E9Q366 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4f2E9Q366 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f2E9Q366 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f2E9Q366 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f2E9Q366 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f2E9Q366 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f2E9Q366 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4f2E9Q366 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4f2E9Q366 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4f2E9Q366 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4f2E9Q366 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4f2E9Q366 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms