Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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