Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfp558E9Q1J0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp558E9Q1J0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp558E9Q1J0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp558E9Q1J0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp558E9Q1J0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp558E9Q1J0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp558E9Q1J0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp558E9Q1J0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp558E9Q1J0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp558E9Q1J0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp558E9Q1J0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp558E9Q1J0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp558E9Q1J0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp558E9Q1J0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp558E9Q1J0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zfp558E9Q1J0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp558E9Q1J0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp558E9Q1J0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp558E9Q1J0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp558E9Q1J0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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