Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdr1E9Q0B4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdr1E9Q0B4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdr1E9Q0B4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdr1E9Q0B4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdr1E9Q0B4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdr1E9Q0B4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdr1E9Q0B4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdr1E9Q0B4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdr1E9Q0B4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdr1E9Q0B4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdr1E9Q0B4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdr1E9Q0B4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdr1E9Q0B4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdr1E9Q0B4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdr1E9Q0B4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdr1E9Q0B4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdr1E9Q0B4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr1E9Q0B4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr1E9Q0B4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr1E9Q0B4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdr1E9Q0B4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdr1E9Q0B4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr1E9Q0B4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdr1E9Q0B4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdr1E9Q0B4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdr1E9Q0B4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdr1E9Q0B4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms