Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm9972E9Q053 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm9972E9Q053 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm9972E9Q053 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm9972E9Q053 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm9972E9Q053 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm9972E9Q053 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm9972E9Q053 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm9972E9Q053 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm9972E9Q053 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm9972E9Q053 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm9972E9Q053 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm9972E9Q053 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm9972E9Q053 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm9972E9Q053 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm9972E9Q053 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm9972E9Q053 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm9972E9Q053 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm9972E9Q053 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm9972E9Q053 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm9972E9Q053 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm9972E9Q053 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm9972E9Q053 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm9972E9Q053 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm9972E9Q053 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm9972E9Q053 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm9972E9Q053 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm9972E9Q053 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm9972E9Q053 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm9972E9Q053 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm9972E9Q053 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm9972E9Q053 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms