Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc175E9PVB3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc175E9PVB3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc175E9PVB3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc175E9PVB3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc175E9PVB3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc175E9PVB3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc175E9PVB3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc175E9PVB3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc175E9PVB3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc175E9PVB3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc175E9PVB3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc175E9PVB3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc175E9PVB3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc175E9PVB3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc175E9PVB3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc175E9PVB3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc175E9PVB3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc175E9PVB3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc175E9PVB3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc175E9PVB3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc175E9PVB3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc175E9PVB3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc175E9PVB3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc175E9PVB3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc175E9PVB3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc175E9PVB3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc175E9PVB3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc175E9PVB3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms