Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm17333C6EQI3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17333C6EQI3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm17333C6EQI3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17333C6EQI3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17333C6EQI3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17333C6EQI3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17333C6EQI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17333C6EQI3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17333C6EQI3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17333C6EQI3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17333C6EQI3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17333C6EQI3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17333C6EQI3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17333C6EQI3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17333C6EQI3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm17333C6EQI3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm17333C6EQI3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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