Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phf11cB4XVP9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Phf11cB4XVP9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf11cB4XVP9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf11cB4XVP9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf11cB4XVP9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf11cB4XVP9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf11cB4XVP9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf11cB4XVP9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf11cB4XVP9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf11cB4XVP9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf11cB4XVP9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf11cB4XVP9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf11cB4XVP9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf11cB4XVP9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf11cB4XVP9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf11cB4XVP9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf11cB4XVP9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf11cB4XVP9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf11cB4XVP9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf11cB4XVP9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf11cB4XVP9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf11cB4XVP9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf11cB4XVP9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf11cB4XVP9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf11cB4XVP9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf11cB4XVP9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf11cB4XVP9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf11cB4XVP9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf11cB4XVP9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf11cB4XVP9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf11cB4XVP9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms