Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabrr3B2RXA8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabrr3B2RXA8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gabrr3B2RXA8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gabrr3B2RXA8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabrr3B2RXA8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabrr3B2RXA8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabrr3B2RXA8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabrr3B2RXA8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gabrr3B2RXA8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gabrr3B2RXA8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gabrr3B2RXA8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabrr3B2RXA8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabrr3B2RXA8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabrr3B2RXA8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabrr3B2RXA8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gabrr3B2RXA8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabrr3B2RXA8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gabrr3B2RXA8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabrr3B2RXA8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabrr3B2RXA8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabrr3B2RXA8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabrr3B2RXA8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabrr3B2RXA8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabrr3B2RXA8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabrr3B2RXA8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabrr3B2RXA8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabrr3B2RXA8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabrr3B2RXA8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gabrr3B2RXA8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms