Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Otud7bB2RUR8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Otud7bB2RUR8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Otud7bB2RUR8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Otud7bB2RUR8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Otud7bB2RUR8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Otud7bB2RUR8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Otud7bB2RUR8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Otud7bB2RUR8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Otud7bB2RUR8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Otud7bB2RUR8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Otud7bB2RUR8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Otud7bB2RUR8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Otud7bB2RUR8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Otud7bB2RUR8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Otud7bB2RUR8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Otud7bB2RUR8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Otud7bB2RUR8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Otud7bB2RUR8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Otud7bB2RUR8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Otud7bB2RUR8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Otud7bB2RUR8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Otud7bB2RUR8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Otud7bB2RUR8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Otud7bB2RUR8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Otud7bB2RUR8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Otud7bB2RUR8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Otud7bB2RUR8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Otud7bB2RUR8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Otud7bB2RUR8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Otud7bB2RUR8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Otud7bB2RUR8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Otud7bB2RUR8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Otud7bB2RUR8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Otud7bB2RUR8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Otud7bB2RUR8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Otud7bB2RUR8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Otud7bB2RUR8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Otud7bB2RUR8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Otud7bB2RUR8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Otud7bB2RUR8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Otud7bB2RUR8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Otud7bB2RUR8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Otud7bB2RUR8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Otud7bB2RUR8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Otud7bB2RUR8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Otud7bB2RUR8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Otud7bB2RUR8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Otud7bB2RUR8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Otud7bB2RUR8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Otud7bB2RUR8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Otud7bB2RUR8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Otud7bB2RUR8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Otud7bB2RUR8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Otud7bB2RUR8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Otud7bB2RUR8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Otud7bB2RUR8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Otud7bB2RUR8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms