Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apba1B2RUJ5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apba1B2RUJ5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apba1B2RUJ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apba1B2RUJ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apba1B2RUJ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apba1B2RUJ5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apba1B2RUJ5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apba1B2RUJ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apba1B2RUJ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apba1B2RUJ5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apba1B2RUJ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apba1B2RUJ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Apba1B2RUJ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apba1B2RUJ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apba1B2RUJ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apba1B2RUJ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apba1B2RUJ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apba1B2RUJ5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Apba1B2RUJ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apba1B2RUJ5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apba1B2RUJ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apba1B2RUJ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apba1B2RUJ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apba1B2RUJ5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apba1B2RUJ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apba1B2RUJ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apba1B2RUJ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apba1B2RUJ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apba1B2RUJ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apba1B2RUJ5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apba1B2RUJ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apba1B2RUJ5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apba1B2RUJ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms