Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC035947B2RQY6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BC035947B2RQY6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC035947B2RQY6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC035947B2RQY6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC035947B2RQY6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC035947B2RQY6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC035947B2RQY6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC035947B2RQY6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC035947B2RQY6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC035947B2RQY6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC035947B2RQY6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC035947B2RQY6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC035947B2RQY6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC035947B2RQY6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC035947B2RQY6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC035947B2RQY6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC035947B2RQY6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC035947B2RQY6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC035947B2RQY6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BC035947B2RQY6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC035947B2RQY6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms