Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Mbd5B1AYB6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Mbd5B1AYB6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Mbd5B1AYB6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Mbd5B1AYB6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Mbd5B1AYB6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Mbd5B1AYB6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Mbd5B1AYB6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Mbd5B1AYB6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Mbd5B1AYB6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Mbd5B1AYB6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Mbd5B1AYB6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Mbd5B1AYB6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Mbd5B1AYB6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Mbd5B1AYB6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Mbd5B1AYB6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Mbd5B1AYB6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Mbd5B1AYB6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Mbd5B1AYB6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Mbd5B1AYB6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Mbd5B1AYB6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Mbd5B1AYB6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Mbd5B1AYB6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Mbd5B1AYB6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Mbd5B1AYB6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Mbd5B1AYB6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Mbd5B1AYB6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Mbd5B1AYB6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Mbd5B1AYB6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Mbd5B1AYB6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Mbd5B1AYB6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Mbd5B1AYB6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Mbd5B1AYB6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Mbd5B1AYB6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Mbd5B1AYB6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Mbd5B1AYB6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Mbd5B1AYB6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Mbd5B1AYB6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Mbd5B1AYB6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Mbd5B1AYB6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Mbd5B1AYB6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Mbd5B1AYB6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Mbd5B1AYB6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Mbd5B1AYB6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Mbd5B1AYB6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Mbd5B1AYB6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Mbd5B1AYB6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Mbd5B1AYB6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Mbd5B1AYB6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Mbd5B1AYB6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Mbd5B1AYB6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Mbd5B1AYB6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Mbd5B1AYB6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Mbd5B1AYB6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Mbd5B1AYB6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Mbd5B1AYB6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Mbd5B1AYB6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Mbd5B1AYB6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Mbd5B1AYB6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Mbd5B1AYB6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Mbd5B1AYB6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Mbd5B1AYB6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Mbd5B1AYB6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Mbd5B1AYB6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Mbd5B1AYB6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Mbd5B1AYB6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Mbd5B1AYB6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Mbd5B1AYB6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Mbd5B1AYB6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Mbd5B1AYB6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Mbd5B1AYB6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Mbd5B1AYB6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Mbd5B1AYB6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Mbd5B1AYB6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Mbd5B1AYB6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Mbd5B1AYB6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Mbd5B1AYB6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Mbd5B1AYB6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Mbd5B1AYB6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Mbd5B1AYB6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Mbd5B1AYB6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Mbd5B1AYB6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Mbd5B1AYB6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Mbd5B1AYB6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Mbd5B1AYB6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Mbd5B1AYB6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Mbd5B1AYB6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms