Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Skint3A7TZF0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Skint3A7TZF0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skint3A7TZF0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skint3A7TZF0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Skint3A7TZF0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Skint3A7TZF0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Skint3A7TZF0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Skint3A7TZF0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Skint3A7TZF0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Skint3A7TZF0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Skint3A7TZF0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Skint3A7TZF0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Skint3A7TZF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Skint3A7TZF0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skint3A7TZF0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skint3A7TZF0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skint3A7TZF0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skint3A7TZF0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skint3A7TZF0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Skint3A7TZF0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Skint3A7TZF0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Skint3A7TZF0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Skint3A7TZF0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Skint3A7TZF0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Skint3A7TZF0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Skint3A7TZF0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Skint3A7TZF0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Skint3A7TZF0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Skint3A7TZF0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Skint3A7TZF0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Skint3A7TZF0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Skint3A7TZF0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Skint3A7TZF0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skint3A7TZF0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skint3A7TZF0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skint3A7TZF0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skint3A7TZF0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skint3A7TZF0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Skint3A7TZF0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Skint3A7TZF0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Skint3A7TZF0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Skint3A7TZF0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skint3A7TZF0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skint3A7TZF0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Skint3A7TZF0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Skint3A7TZF0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Skint3A7TZF0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Skint3A7TZF0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Skint3A7TZF0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Skint3A7TZF0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Skint3A7TZF0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Skint3A7TZF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Skint3A7TZF0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Skint3A7TZF0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Skint3A7TZF0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skint3A7TZF0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skint3A7TZF0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Skint3A7TZF0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Skint3A7TZF0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Skint3A7TZF0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skint3A7TZF0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skint3A7TZF0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skint3A7TZF0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skint3A7TZF0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Skint3A7TZF0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Skint3A7TZF0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Skint3A7TZF0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Skint3A7TZF0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Skint3A7TZF0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Skint3A7TZF0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Skint3A7TZF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Skint3A7TZF0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Skint3A7TZF0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Skint3A7TZF0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Skint3A7TZF0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Skint3A7TZF0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Skint3A7TZF0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Skint3A7TZF0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Skint3A7TZF0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Skint3A7TZF0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Skint3A7TZF0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Skint3A7TZF0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Skint3A7TZF0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Skint3A7TZF0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Skint3A7TZF0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Skint3A7TZF0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skint3A7TZF0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skint3A7TZF0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Skint3A7TZF0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Skint3A7TZF0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Skint3A7TZF0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Skint3A7TZF0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Skint3A7TZF0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Skint3A7TZF0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Skint3A7TZF0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Skint3A7TZF0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Skint3A7TZF0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Skint3A7TZF0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Skint3A7TZF0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms