Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3173A6NAS3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3173A6NAS3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3173A6NAS3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3173A6NAS3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3173A6NAS3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3173A6NAS3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3173A6NAS3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3173A6NAS3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm3173A6NAS3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm3173A6NAS3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3173A6NAS3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm3173A6NAS3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3173A6NAS3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3173A6NAS3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3173A6NAS3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3173A6NAS3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3173A6NAS3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3173A6NAS3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3173A6NAS3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3173A6NAS3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3173A6NAS3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3173A6NAS3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3173A6NAS3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3173A6NAS3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms