Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Odf2A3KGV1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Odf2A3KGV1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Odf2A3KGV1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Odf2A3KGV1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Odf2A3KGV1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Odf2A3KGV1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Odf2A3KGV1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Odf2A3KGV1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Odf2A3KGV1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Odf2A3KGV1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Odf2A3KGV1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Odf2A3KGV1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Odf2A3KGV1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Odf2A3KGV1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Odf2A3KGV1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Odf2A3KGV1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Odf2A3KGV1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Odf2A3KGV1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Odf2A3KGV1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Odf2A3KGV1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Odf2A3KGV1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Odf2A3KGV1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Odf2A3KGV1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Odf2A3KGV1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Odf2A3KGV1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Odf2A3KGV1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Odf2A3KGV1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Odf2A3KGV1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Odf2A3KGV1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Odf2A3KGV1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Odf2A3KGV1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Odf2A3KGV1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Odf2A3KGV1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Odf2A3KGV1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Odf2A3KGV1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Odf2A3KGV1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Odf2A3KGV1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Odf2A3KGV1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Odf2A3KGV1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Odf2A3KGV1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Odf2A3KGV1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Odf2A3KGV1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Odf2A3KGV1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Odf2A3KGV1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Odf2A3KGV1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms