Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Upf2A2AT37 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Upf2A2AT37 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Upf2A2AT37 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Upf2A2AT37 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Upf2A2AT37 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Upf2A2AT37 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Upf2A2AT37 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Upf2A2AT37 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Upf2A2AT37 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Upf2A2AT37 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Upf2A2AT37 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Upf2A2AT37 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Upf2A2AT37 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Upf2A2AT37 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Upf2A2AT37 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Upf2A2AT37 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Upf2A2AT37 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Upf2A2AT37 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Upf2A2AT37 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Upf2A2AT37 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Upf2A2AT37 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Upf2A2AT37 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Upf2A2AT37 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Upf2A2AT37 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Upf2A2AT37 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Upf2A2AT37 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Upf2A2AT37 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Upf2A2AT37 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Upf2A2AT37 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Upf2A2AT37 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Upf2A2AT37 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Upf2A2AT37 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Upf2A2AT37 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Upf2A2AT37 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Upf2A2AT37 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Upf2A2AT37 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Upf2A2AT37 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Upf2A2AT37 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Upf2A2AT37 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Upf2A2AT37 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Upf2A2AT37 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Upf2A2AT37 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Upf2A2AT37 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Upf2A2AT37 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Upf2A2AT37 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Upf2A2AT37 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Upf2A2AT37 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Upf2A2AT37 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Upf2A2AT37 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Upf2A2AT37 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Upf2A2AT37 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Upf2A2AT37 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Upf2A2AT37 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Upf2A2AT37 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Upf2A2AT37 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Upf2A2AT37 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Upf2A2AT37 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Upf2A2AT37 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Upf2A2AT37 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Upf2A2AT37 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Upf2A2AT37 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Upf2A2AT37 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Upf2A2AT37 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Upf2A2AT37 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Upf2A2AT37 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Upf2A2AT37 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Upf2A2AT37 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Upf2A2AT37 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Upf2A2AT37 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Upf2A2AT37 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Upf2A2AT37 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Upf2A2AT37 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Upf2A2AT37 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Upf2A2AT37 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Upf2A2AT37 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Upf2A2AT37 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Upf2A2AT37 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Upf2A2AT37 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Upf2A2AT37 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Upf2A2AT37 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Upf2A2AT37 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Upf2A2AT37 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Upf2A2AT37 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Upf2A2AT37 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms