Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtcflA2APF3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtcflA2APF3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtcflA2APF3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CtcflA2APF3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtcflA2APF3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CtcflA2APF3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtcflA2APF3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtcflA2APF3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CtcflA2APF3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtcflA2APF3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtcflA2APF3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CtcflA2APF3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtcflA2APF3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtcflA2APF3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtcflA2APF3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtcflA2APF3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtcflA2APF3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtcflA2APF3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CtcflA2APF3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtcflA2APF3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtcflA2APF3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtcflA2APF3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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