Protein–RNA interactions for Protein: A2AJW4

Ppp1r3d, Protein phosphatase 1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3dA2AJW4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp1r3dA2AJW4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3dA2AJW4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r3dA2AJW4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3dA2AJW4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms