Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Prdm2A2A7B5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Prdm2A2A7B5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Prdm2A2A7B5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Prdm2A2A7B5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Prdm2A2A7B5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Prdm2A2A7B5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Prdm2A2A7B5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Prdm2A2A7B5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Prdm2A2A7B5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Prdm2A2A7B5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Prdm2A2A7B5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Prdm2A2A7B5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Prdm2A2A7B5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Prdm2A2A7B5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Prdm2A2A7B5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Prdm2A2A7B5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Prdm2A2A7B5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Prdm2A2A7B5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Prdm2A2A7B5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Prdm2A2A7B5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Prdm2A2A7B5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Prdm2A2A7B5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Prdm2A2A7B5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Prdm2A2A7B5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Prdm2A2A7B5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Prdm2A2A7B5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Prdm2A2A7B5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Prdm2A2A7B5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Prdm2A2A7B5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Prdm2A2A7B5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Prdm2A2A7B5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Prdm2A2A7B5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Prdm2A2A7B5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Prdm2A2A7B5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Prdm2A2A7B5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Prdm2A2A7B5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Prdm2A2A7B5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Prdm2A2A7B5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Prdm2A2A7B5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Prdm2A2A7B5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Prdm2A2A7B5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Prdm2A2A7B5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Prdm2A2A7B5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Prdm2A2A7B5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Prdm2A2A7B5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Prdm2A2A7B5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Prdm2A2A7B5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Prdm2A2A7B5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Prdm2A2A7B5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Prdm2A2A7B5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Prdm2A2A7B5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Prdm2A2A7B5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Prdm2A2A7B5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Prdm2A2A7B5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Prdm2A2A7B5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Prdm2A2A7B5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Prdm2A2A7B5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Prdm2A2A7B5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Prdm2A2A7B5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Prdm2A2A7B5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Prdm2A2A7B5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Prdm2A2A7B5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Prdm2A2A7B5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Prdm2A2A7B5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Prdm2A2A7B5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Prdm2A2A7B5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Prdm2A2A7B5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Prdm2A2A7B5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Prdm2A2A7B5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Prdm2A2A7B5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Prdm2A2A7B5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Prdm2A2A7B5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Prdm2A2A7B5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Prdm2A2A7B5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Prdm2A2A7B5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Prdm2A2A7B5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Prdm2A2A7B5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Prdm2A2A7B5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Prdm2A2A7B5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Prdm2A2A7B5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Prdm2A2A7B5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Prdm2A2A7B5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Prdm2A2A7B5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Prdm2A2A7B5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Prdm2A2A7B5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Prdm2A2A7B5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Prdm2A2A7B5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Prdm2A2A7B5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Prdm2A2A7B5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Prdm2A2A7B5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Prdm2A2A7B5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Prdm2A2A7B5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Prdm2A2A7B5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Prdm2A2A7B5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Prdm2A2A7B5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Prdm2A2A7B5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Prdm2A2A7B5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Prdm2A2A7B5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Prdm2A2A7B5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms